MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanolobus psychrophilus R15 chromosome

Total Repeats: 49295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018876	AGT	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669211
2	NC_018876	TAT	2	6	194	199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669211
3	NC_018876	AAT	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669211
4	NC_018876	ATTG	2	8	246	253	25 %	50 %	25 %	0 %	410669211
5	NC_018876	AAG	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669211
6	NC_018876	AT	3	6	282	287	50 %	50 %	0 %	0 %	410669211
7	NC_018876	GAT	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669211
8	NC_018876	AT	3	6	383	388	50 %	50 %	0 %	0 %	410669211
9	NC_018876	TGTT	2	8	417	424	0 %	75 %	25 %	0 %	410669211
10	NC_018876	GAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
11	NC_018876	GAA	2	6	591	596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669212
12	NC_018876	ATTG	2	8	648	655	25 %	50 %	25 %	0 %	410669212
13	NC_018876	AGAAC	2	10	691	700	60 %	0 %	20 %	20 %	410669212
14	NC_018876	GGC	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410669212
15	NC_018876	ACA	2	6	758	763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669212
16	NC_018876	AGAA	2	8	907	914	75 %	0 %	25 %	0 %	410669212
17	NC_018876	A	6	6	963	968	100 %	0 %	0 %	0 %	410669212
18	NC_018876	GAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
19	NC_018876	TGA	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
20	NC_018876	A	7	7	1079	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	410669212
21	NC_018876	ATT	2	6	1122	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669212
22	NC_018876	AGA	2	6	1149	1154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669212
23	NC_018876	ACA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669212
24	NC_018876	ATCT	2	8	1195	1202	25 %	50 %	0 %	25 %	410669212
25	NC_018876	AGT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
26	NC_018876	GCA	2	6	1263	1268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410669212
27	NC_018876	CTT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410669212
28	NC_018876	ACA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669212
29	NC_018876	TGA	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669212
30	NC_018876	TCA	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669212
31	NC_018876	AAGG	2	8	1487	1494	50 %	0 %	50 %	0 %	410669212
32	NC_018876	AAC	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669213
33	NC_018876	A	7	7	1605	1611	100 %	0 %	0 %	0 %	410669213
34	NC_018876	TCC	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410669213
35	NC_018876	ACA	2	6	2419	2424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669214
36	NC_018876	TCCA	2	8	2439	2446	25 %	25 %	0 %	50 %	410669214
37	NC_018876	AGA	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669214
38	NC_018876	ACA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669214
39	NC_018876	AAGG	2	8	2542	2549	50 %	0 %	50 %	0 %	410669214
40	NC_018876	AGGA	2	8	2591	2598	50 %	0 %	50 %	0 %	410669214
41	NC_018876	TACA	2	8	2607	2614	50 %	25 %	0 %	25 %	410669214
42	NC_018876	AGG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669214
43	NC_018876	CAGT	2	8	2654	2661	25 %	25 %	25 %	25 %	410669214
44	NC_018876	TAT	2	6	2677	2682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669214
45	NC_018876	CAT	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669214
46	NC_018876	TGA	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669214
47	NC_018876	AAT	2	6	2786	2791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669214
48	NC_018876	ATCA	2	8	2978	2985	50 %	25 %	0 %	25 %	410669215
49	NC_018876	A	6	6	3014	3019	100 %	0 %	0 %	0 %	410669215
50	NC_018876	TTA	2	6	3031	3036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669215
51	NC_018876	GCT	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
52	NC_018876	AGATAC	2	12	3113	3124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410669215
53	NC_018876	GCCA	2	8	3141	3148	25 %	0 %	25 %	50 %	410669215
54	NC_018876	CTG	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
55	NC_018876	ATG	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669215
56	NC_018876	CTG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
57	NC_018876	ACC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410669215
58	NC_018876	AGA	2	6	3232	3237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669215
59	NC_018876	CTG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669215
60	NC_018876	CGG	3	9	3307	3315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410669215
61	NC_018876	TTTGC	2	10	3342	3351	0 %	60 %	20 %	20 %	410669215
62	NC_018876	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669215
63	NC_018876	TAT	2	6	3392	3397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669215
64	NC_018876	ATG	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669215
65	NC_018876	AGT	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669215
66	NC_018876	T	6	6	3518	3523	0 %	100 %	0 %	0 %	410669215
67	NC_018876	CAT	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669215
68	NC_018876	TAT	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669215
69	NC_018876	TCA	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669215
70	NC_018876	GTA	2	6	3750	3755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669216
71	NC_018876	CTG	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669216
72	NC_018876	CAG	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410669216
73	NC_018876	AAAT	2	8	3879	3886	75 %	25 %	0 %	0 %	410669216
74	NC_018876	TTA	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669216
75	NC_018876	TCA	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669216
76	NC_018876	AAAT	2	8	4032	4039	75 %	25 %	0 %	0 %	410669216
77	NC_018876	A	6	6	4041	4046	100 %	0 %	0 %	0 %	410669216
78	NC_018876	GGTT	2	8	4047	4054	0 %	50 %	50 %	0 %	410669216
79	NC_018876	GCT	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410669216
80	NC_018876	ATC	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669216
81	NC_018876	TC	3	6	4109	4114	0 %	50 %	0 %	50 %	410669216
82	NC_018876	T	7	7	4179	4185	0 %	100 %	0 %	0 %	410669216
83	NC_018876	GGA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669216
84	NC_018876	AATCT	2	10	4205	4214	40 %	40 %	0 %	20 %	410669216
85	NC_018876	AGA	2	6	4300	4305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669216
86	NC_018876	ATT	2	6	4320	4325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669216
87	NC_018876	AAG	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669216
88	NC_018876	TCA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669216
89	NC_018876	ATCT	2	8	4490	4497	25 %	50 %	0 %	25 %	410669216
90	NC_018876	AAAT	2	8	4875	4882	75 %	25 %	0 %	0 %	410669217
91	NC_018876	ACT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669217
92	NC_018876	AAT	2	6	5091	5096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669217
93	NC_018876	AGG	2	6	5097	5102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669217
94	NC_018876	TCA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669217
95	NC_018876	A	6	6	5142	5147	100 %	0 %	0 %	0 %	410669217
96	NC_018876	GATTT	2	10	5157	5166	20 %	60 %	20 %	0 %	410669217
97	NC_018876	TAA	2	6	5205	5210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669217
98	NC_018876	AAGT	2	8	5313	5320	50 %	25 %	25 %	0 %	410669217
99	NC_018876	TCTT	2	8	5358	5365	0 %	75 %	0 %	25 %	410669217
100	NC_018876	ATC	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
101	NC_018876	TAA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669218
102	NC_018876	ATA	2	6	5586	5591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669218
103	NC_018876	TA	3	6	5741	5746	50 %	50 %	0 %	0 %	410669218
104	NC_018876	AT	3	6	5770	5775	50 %	50 %	0 %	0 %	410669218
105	NC_018876	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	410669218
106	NC_018876	ATC	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
107	NC_018876	AAT	2	6	5869	5874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669218
108	NC_018876	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669218
109	NC_018876	TCA	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
110	NC_018876	TTG	2	6	6073	6078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410669218
111	NC_018876	ATC	2	6	6114	6119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669218
112	NC_018876	GT	3	6	6138	6143	0 %	50 %	50 %	0 %	410669218
113	NC_018876	TCGT	2	8	6163	6170	0 %	50 %	25 %	25 %	410669218
114	NC_018876	GCA	2	6	6272	6277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410669218
115	NC_018876	TCTCT	2	10	6294	6303	0 %	60 %	0 %	40 %	410669218
116	NC_018876	TTC	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410669218
117	NC_018876	CAA	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669219
118	NC_018876	T	7	7	6637	6643	0 %	100 %	0 %	0 %	410669219
119	NC_018876	CT	3	6	6659	6664	0 %	50 %	0 %	50 %	410669219
120	NC_018876	ATA	2	6	6686	6691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410669219
121	NC_018876	TTTGA	2	10	6707	6716	20 %	60 %	20 %	0 %	410669219
122	NC_018876	TGAC	2	8	6723	6730	25 %	25 %	25 %	25 %	410669219
123	NC_018876	GGT	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410669219
124	NC_018876	TC	3	6	6818	6823	0 %	50 %	0 %	50 %	410669219
125	NC_018876	ATG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669219
126	NC_018876	ATT	2	6	6878	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669219
127	NC_018876	T	6	6	6909	6914	0 %	100 %	0 %	0 %	410669219
128	NC_018876	CA	4	8	6924	6931	50 %	0 %	0 %	50 %	410669219
129	NC_018876	TCT	2	6	6932	6937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410669219
130	NC_018876	T	6	6	7022	7027	0 %	100 %	0 %	0 %	410669219
131	NC_018876	T	6	6	7133	7138	0 %	100 %	0 %	0 %	410669220
132	NC_018876	T	8	8	7156	7163	0 %	100 %	0 %	0 %	410669220
133	NC_018876	TCT	2	6	7187	7192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410669220
134	NC_018876	TTA	2	6	7288	7293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410669220
135	NC_018876	CAA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669220
136	NC_018876	T	7	7	7353	7359	0 %	100 %	0 %	0 %	410669220
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255	NC_018876	TAC	2	6	15928	15933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410669229
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262	NC_018876	CAA	2	6	16551	16556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410669230
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264	NC_018876	AGG	3	9	16628	16636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669230
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266	NC_018876	TGA	2	6	16665	16670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669230
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269	NC_018876	TTC	2	6	16892	16897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410669231
270	NC_018876	GAA	2	6	16967	16972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410669231
271	NC_018876	TGA	2	6	16987	16992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410669231
272	NC_018876	TGG	2	6	17007	17012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410669231
273	NC_018876	GGA	2	6	17100	17105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410669231
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280	NC_018876	TGCAG	2	10	17420	17429	20 %	20 %	40 %	20 %	410669231
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